Az Intézet a 2002/2003. tanév első szemeszterében kezdte meg működését, vezetésére Prof. Dr. Paál Tamás kapott megbízást. Az Intézet nevének megválasztását az induláskor oktatott két tárgy határozta meg. Mind a minőségbiztosítás, mind a gyógyszerügyeket irányító jog- és szakmai szabályok hatósági felügyeleti követelményeknek való megfelelést, ezek ismeretét kívánják meg, így lett az Intézet neve Gyógyszerfelügyeleti Intézet.
A Gyógyszerfelügyeleti Intézet oktatói jelenleg összesen 9 tantárgy oktatását végzik. Ezek közül 4 főtárgy (Jogi alapismeretek, Közgazdaságtani alapismeretek, Gyógyszerészi etika, Gyógyszerügyi szakigazgatás), 1 kötelezően választható tárgy (Minőségbiztosítás), 4 szabadon választható tárgy (A kommunikáció alapjai, Kommunikáció a gyógyszerészi gyakorlatban, A szimbolikus matematikai logika alapjai, Vállalkozás-menedzsment gyógyszerészhallgatók számára) található magyar és angol nyelven. Az SZTE bármely hallgatója számára hozzáférhető a Gyógyszerügyi szabályozás szabadon választható tantárgyként. Két szakterületen (Minőségbiztosítás és Gyógyszerügyi szakigazgatás) szervez kurzusokat a szakgyógyszerészképzésben és több tárgyban érintett a karon folyó gyógyszertári asszisztensképzésben. Éves szinten 5-6 fő diplomamunka készül az intézetben.
Az intézet megalakulását (2003) követően a minőségbiztosítás tudományterületén belül két témakörrel csatlakozott a Gyógyszertudományok Doktori Iskola Gyógyszertechnológia programjához: (a) A különböző gyártási és egyéb folyamatok kritikus lépései, validálás és minõségbiztosítás kidolgozása; valamint (b) A hatósági szabályozások eredményességének vizsgálata a gyógyszerügy területén címmel. A gyógyszertörzskönyvezés hatósági és a gyógyszertechnológiai kutatói tapasztalatok integrálásával kialakított ún. „regulatory pharmacy” tudományterület gondozása úttörő jellegű és hiánypótló kezdeményezés.
Az intézet 2004-től kezdődően részt vesz egyetemi szintű minőségbiztosítási rendszer építésével foglalkozó pályázatokban és egyéb, felsőoktatás minőségével kapcsolatos fejlesztő tevékenységekben.
Az Intézet ezt a tevékenységet jelenleg 2 főállású és 1 fő félállásban alkalmazott oktatóval és további óraadó szakemberek bevonásával végzi.